В заказнике выделяются три зоны, различающиеся по режиму использования: особо защитная зона – гора Масим, зона буферной защиты заповедника «Шульган-Таш» и водосбора карстовой системы Каповой пещеры, а также зона заказного режима, включающая всю остальную территорию заказника. 

На территории заказника устанавливается режим особой охраны и использования природных ресурсов, направленный на сохранение природного комплекса, обеспечение природного равновесия растительного и животного мира. 

Деятельность "Алтын Солок" будет осуществляться должностными лицами ГКУ Дирекция по особо охраняемым природным территориям РБ.